Le HCC débutera le championnat de LNB 2016-2017 le vendredi 9 septembre face à Ajoie, champion en titre, aux Mélèzes. Les Chaux-de-Fonniers enchaîneront ensuite par un déplacement à Martigny le 10 septembre avant de recevoir les Ticino Rockets de Kenny Camarda le mardi 13 septembre.
Le calendrier comprendra 48 matches. En plus de quatre tours de onze matches, le HCC affrontera à Ajoie et Martigny à deux reprises supplémentaires dans un cinquième tour «régional». Les Chaux-de-Fonniers termineront leur saison régulière par un autre derby à Porrentruy contre Ajoie, le dimanche 12 février.