A l’instar d’une dizaine de zoos et parcs animaliers, le Bois du Petit Château a été expertisé par le Service spécialisé Animaux sauvages de la Protection suisse des animaux. Le rapport 2012 met en évidence les types de détention positifs et négatifs des espèces les plus diverses.
Au Bois du Petit-Château, les critiques portent sur le vivarium, où le caïman Yacaré et le varan du Nil disposent de bassins trop petits. Contacté, Arnaud Maeder, directeur des institutions zoologiques de La Chaux-de-Fonds, répond à ces critiques. Si celles-ci sont avérées pour les cas précités, il rappelle les objectifs du parc zoologique et pose cette question, volontairement provocatrice: “Si on veut plus d’espaces pour moins d’espèces, faut-il euthanasier les animaux dont on ne veut plus?”