A l'image de certains produits de nettoyage, ce jeu ne nous propose pas un univers mais bien deux pour le prix d'un! En effet, les deux éditeurs des licences "Professeur Layton" et "Phoenix Wright" ont décidé d'oeuvrer main dans la main afin de nous proposer un mélange de ces deux mondes. Un des choix des développeurs a été de conserver le gameplay de chaque licence et de les alterner durant les phases de jeu. Ainsi, les fans n'auront tout simplement pas à apprendre un nouveau gameplay et retrouveront celui qui a fait la force de chacune des licences.
Le professeur Layton est plus axé sur les enquêtes et les énigmes cachées tandis que Phoenix Wright s'occupe principalement des témoignages au tribunal. Phoenix Wright, son assistante ainsi que le professeur Layton sont mystérieusement plongés dans une cité médiévale. Il y aura donc des gens accusés de sorcellerie dont il faudra écouter...