Au vu de l'importance de la mortalité chez les populations de truites et d'ombres, les administrations suisses et françaises en charge de la gestion de la pêche dans le Doubs vont réaliser des inventaires piscicoles par pêche à l'électricité le long des tronçons concernés. Ces investigations fourniront de précieuses informations sur l'état des populations piscicoles et permettront d'évaluer la nécessité d'adapter la pression de pêche.
En 2010 et 2011, une mortalité de forte ampleur a touché la faune piscicole du Doubs jurassien et franco-suisse. Les poissons malades, essentiellement des truites et des ombres, présentaient un développement important de «mycoses» de type «saprolegnia» sur le corps et la tête. Les investigations vétérinaires n'ont mis en évidence aucun indice d'agent infectieux à l'origine du fort développement de cette «mycose» chez les poissons. Depuis cet été, les mortalités semblent avoir cessé. Afin d'évaluer l'état actuel des populations de poissons, huit inventaires par pêche à l'électricité seront réalisés durant le mois de septembre sur le linéaire concerné, trois sur le tronçon mitoyen (F-NE), deux sur le tronçon franco-suisse (F-JU) et trois sur la boucle jurassienne: aujourd'hui à Montmelon-Tariche, demain à Ocourt et jeudi à St-Ursanne. Les personnes souhaitant y assister doivent s'annoncer au 032 435 59 65. / comm