Yvan Perrin est sous enquête disciplinaire après avoir tenu des propos controversés sur la torture en mai. Le politicien UDC dément en revanche que cela soit lié à sa volonté de mettre un terme à sa carrière de policier début 2012.
L'enquêteur dit vouloir retrouver une totale liberté de parole notamment pour les élections au Conseil d'Etat neuchâtelois de 2013, où il s'annonce d'ores et déjà candidat à la candidature.